47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1411 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  100 
 
 		 312 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  85.11 
 
 		 305 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  37.8 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  37.8 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  38.82 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  35.8 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  36.76 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  33.33 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  33.6 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  34.65 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  35.89 
 
 		 397 aa  148  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  32.38 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  35.68 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  30.08 
 
 		 254 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  32.78 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  34.22 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  33.33 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  35.37 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  32.51 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  29.75 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  33.07 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  29.36 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  30.39 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  28.92 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  27.8 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  25.37 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  25.37 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  26.42 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  23.11 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  27.32 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  25.37 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  24.76 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  26.98 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  26.98 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  26.98 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  22.52 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  21.93 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  25.37 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  25.37 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  24.88 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  22.13 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  24.88 
 
 		 251 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  24.39 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  24.06 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  23.41 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  23 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  22.17 
 
 		 250 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>