71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1297 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  838    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.65 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  54.27 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  55 
 
 		 464 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  53.8 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  52.83 
 
 		 455 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  51.83 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  52.74 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  54.89 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.59 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  50.64 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.36 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.39 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  50.97 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  53.75 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  53.02 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  49.26 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  52.52 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  53.49 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  50.74 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  50.53 
 
 		 462 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  51.36 
 
 		 557 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  51.92 
 
 		 464 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  51.6 
 
 		 457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  51.95 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  50.22 
 
 		 454 aa  348  9e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  55.38 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  48.6 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  51.45 
 
 		 439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  52.06 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  54.72 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  49.35 
 
 		 466 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  53.45 
 
 		 505 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  47.06 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.97 
 
 		 446 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  54.17 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  54.26 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.2 
 
 		 478 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  48.25 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  46.57 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  53.07 
 
 		 493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  47.89 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  49.54 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  47.33 
 
 		 476 aa  299  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  49.25 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  50.13 
 
 		 473 aa  266  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  38.9 
 
 		 483 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  41.15 
 
 		 509 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  40.66 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.22 
 
 		 523 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  39.25 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.32 
 
 		 532 aa  153  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  39.44 
 
 		 501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  33.25 
 
 		 477 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.38 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  50.94 
 
 		 840 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  49.49 
 
 		 673 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.03 
 
 		 767 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  40.46 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.2 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  32.13 
 
 		 2160 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  26.87 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  30.92 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.63 
 
 		 759 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  32.56 
 
 		 362 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  32.79 
 
 		 530 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.38 
 
 		 593 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1106 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  25.09 
 
 		 1359 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  32.61 
 
 		 717 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>