More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1272 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 368 aa  742    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  87.78 
 
 		 360 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  56.87 
 
 		 364 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  57.92 
 
 		 365 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  55.67 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  58.15 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  60.22 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  57.99 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  57.99 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  57.72 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  57.85 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  57.45 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  56.52 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  56.82 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  58.54 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  55.08 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  53.18 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  54.57 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  52.03 
 
 		 377 aa  361  9e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  54.59 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  52.83 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  50 
 
 		 376 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0192  D-alanine/D-alanine ligase  54.69 
 
 		 374 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  53.03 
 
 		 376 aa  352  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  53.01 
 
 		 377 aa  353  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  53.12 
 
 		 386 aa  345  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  48.8 
 
 		 382 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  52.3 
 
 		 369 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  48.66 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  48.66 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  47.72 
 
 		 389 aa  325  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  50.13 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  49.44 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  47.47 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  45.32 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  42.44 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  43.01 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  43.4 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  41.98 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  44.99 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  41.71 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  41.71 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  44.62 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18500  D-alanine--D-alanine ligase  45.16 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  41.29 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  43.12 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  42.03 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  41.99 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  40.63 
 
 		 380 aa  285  9e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  41.94 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.63 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  42.23 
 
 		 364 aa  282  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  42.7 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  45.19 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  42.55 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  41.67 
 
 		 376 aa  278  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  39.46 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  42.66 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  42.31 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  42.31 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  40.66 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  42.58 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  42.31 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  43.24 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  41.99 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  40.27 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  42.03 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  40.6 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  43.21 
 
 		 371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  40.49 
 
 		 362 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  40.81 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  37.84 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  41.16 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  45.23 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  42.78 
 
 		 361 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  41.85 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  40.93 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  40.38 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  40.38 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  47.27 
 
 		 351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  37.94 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  37.94 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  41.37 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  39.78 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  43.31 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  41.3 
 
 		 363 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  39.78 
 
 		 351 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  38.17 
 
 		 351 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>