More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1260 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 237 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  92.11 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  62.5 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 185 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  56.03 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  60.42 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 98 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  55.43 
 
 		 93 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  63.04 
 
 		 285 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  56.82 
 
 		 99 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 163 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 93 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 222 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  53.54 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  60 
 
 		 214 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  57.14 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  57.14 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  57.14 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 94 aa  92  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  52.33 
 
 		 94 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  48.86 
 
 		 91 aa  88.6  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  46.07 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  44.32 
 
 		 91 aa  80.9  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  43.18 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  43.33 
 
 		 95 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  46.07 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  48.78 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  44.9 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 90 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 		 90 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  46.07 
 
 		 91 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  47.06 
 
 		 98 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  47.13 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  45.45 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  39.13 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  38.64 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  38.64 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  42.53 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  44.57 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  38.64 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3445  hypothetical protein  43.82 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106732  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  42.05 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  41.57 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  38.64 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>