More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1245 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1245  ATPase  100 
 
 		 348 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  93.97 
 
 		 369 aa  628  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.22 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.87 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  69.97 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  68.05 
 
 		 345 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  68.59 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  64.88 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.75 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.18 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.41 
 
 		 346 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  63.49 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  62.15 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  61.54 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  61.54 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  62.54 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  61.54 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  68.71 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  65.31 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.88 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.3 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.14 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  62.86 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  69.33 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.28 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.33 
 
 		 354 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  56.77 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  56.35 
 
 		 345 aa  361  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  56.13 
 
 		 344 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  54.97 
 
 		 337 aa  355  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  55.16 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.86 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  55.81 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  51.33 
 
 		 331 aa  329  5.0000000000000004e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 		 342 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  49.51 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.79 
 
 		 350 aa  318  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  48.85 
 
 		 334 aa  318  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  45.54 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.41 
 
 		 329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.2 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  46.35 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  52.68 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.04 
 
 		 333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.71 
 
 		 317 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.21 
 
 		 333 aa  311  9e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.81 
 
 		 325 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  49.84 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  46.41 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  50.33 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  49.84 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.44 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.69 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  51.25 
 
 		 321 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.5 
 
 		 329 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.99 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  49.84 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  44.92 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.75 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.305004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  50.49 
 
 		 318 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.56 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  51.8 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  48.25 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  46.73 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.47 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  52.32 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50.32 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  49.35 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  51.62 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  48.04 
 
 		 332 aa  291  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  50.31 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.03 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.04 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  49.03 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  49.03 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  49.03 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.72 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  49.35 
 
 		 316 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  50 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2449  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.11 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281156  decreased coverage  0.00339489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  49.03 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  49.84 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  49.03 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  50.82 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  49.03 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  50 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  50 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  49.67 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  49.38 
 
 		 347 aa  288  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1989  Von Willebrand factor type A domain containing membrane protein  48.08 
 
 		 359 aa  288  7e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  49.03 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.77 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.86 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  47.83 
 
 		 322 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  47.4 
 
 		 331 aa  285  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  47.09 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  44.87 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>