More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1206 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  95.72 
 
 		 257 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.92 
 
 		 257 aa  360  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  68.87 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  66.15 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  65.64 
 
 		 288 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.15 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.65 
 
 		 257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  63.36 
 
 		 262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.09 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  60.62 
 
 		 259 aa  292  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.16 
 
 		 262 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.31 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.63 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  60.78 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.92 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  62.4 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.39 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.82 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  48.44 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  48.41 
 
 		 257 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  48.05 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  48.43 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  48.41 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  47.83 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.01 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  47.83 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  47.83 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.78 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  47.04 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.24 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.88 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.67 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  47.39 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.34 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.74 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  48.26 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  42.58 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.41 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.71 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.63 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 		 258 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.27 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  45.17 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.92 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  46.43 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.62 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.24 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.08 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.02 
 
 		 259 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5078  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.4 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  48.64 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.8 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>