153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1122 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 607 aa  1159    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  90.38 
 
 		 551 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  38.06 
 
 		 559 aa  253  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  43.12 
 
 		 869 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  35.12 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.01 
 
 		 564 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  35.3 
 
 		 565 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  31.49 
 
 		 649 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  38.01 
 
 		 605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  30.98 
 
 		 578 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.35 
 
 		 613 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.24 
 
 		 927 aa  93.2  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  23.47 
 
 		 544 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  22.22 
 
 		 547 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.1 
 
 		 544 aa  87.4  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  22.63 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  22.63 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  22.76 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  22.56 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  22.28 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  39.35 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  26.08 
 
 		 663 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 593 aa  83.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.18 
 
 		 197 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  22.3 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  29.22 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  39.47 
 
 		 188 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 184 aa  79  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  27.42 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  40.98 
 
 		 210 aa  76.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 174 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 174 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.44 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  29.64 
 
 		 697 aa  74.3  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 174 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  37.6 
 
 		 126 aa  72.8  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  38.89 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  41.82 
 
 		 180 aa  70.5  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 223 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  39 
 
 		 244 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  39.26 
 
 		 226 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 178 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.54 
 
 		 233 aa  68.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  27.11 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  39.26 
 
 		 226 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 196 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  41.88 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  30.24 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  38.39 
 
 		 118 aa  64.7  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  26.04 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  27.87 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  33.87 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  30.29 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  38.05 
 
 		 119 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.21 
 
 		 172 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  37.78 
 
 		 199 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 197 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 225 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  32.48 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  42.06 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  27.56 
 
 		 512 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 193 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  36.78 
 
 		 184 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  31.61 
 
 		 226 aa  59.3  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 197 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  35.71 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  40.21 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  30.32 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  34.02 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  35.38 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  35.38 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  35.5 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33.96 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  32.39 
 
 		 309 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 203 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  39.81 
 
 		 198 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  32.68 
 
 		 309 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  33.99 
 
 		 681 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  33.7 
 
 		 309 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  33.7 
 
 		 309 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  24.11 
 
 		 439 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.1 
 
 		 731 aa  54.3  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.59 
 
 		 214 aa  53.9  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.21 
 
 		 686 aa  53.9  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 424 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  29.6 
 
 		 310 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 128 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 128 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 128 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 124 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>