More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1093 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 369 aa  711    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  86.18 
 
 		 369 aa  569  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  35.12 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  38.74 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  30.71 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  30.43 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  35.92 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  31.42 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30.68 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  33.14 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  33.63 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  31.09 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  34.35 
 
 		 376 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.16 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.36 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  32.86 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  32.49 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  31.67 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  32.73 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.11 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.19 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.65 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  33.44 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  32.52 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  33.05 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.87 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  32.86 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  32.01 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  34.17 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  30.86 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  31.88 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  34.78 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.87 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  32.49 
 
 		 388 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  27.37 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  30 
 
 		 396 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  32.03 
 
 		 408 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  30.03 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  32.31 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.66 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  33.05 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  32.6 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  33.61 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  24.92 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.83 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.69 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  30.29 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32.55 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  32.13 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.52 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.88 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 367 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.48 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  32.92 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.26 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  30.28 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.26 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.88 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.52 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.82 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.95 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.77 
 
 		 404 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  35 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.23 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.78 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  29.17 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  29.17 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  29.17 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  29.17 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  28.8 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  32.51 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  31.67 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  29.45 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 		 410 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  35.53 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.2 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  31.62 
 
 		 397 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.48 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.28 
 
 		 404 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.5 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  32.82 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.71 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  32.82 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  29.58 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.73 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.73 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.12 
 
 		 386 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  29.52 
 
 		 397 aa  92.8  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.2 
 
 		 364 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  32.46 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>