More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1065 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  69.09 
 
 
276 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  53.44 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  46.99 
 
 
272 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  49.81 
 
 
284 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  46.9 
 
 
272 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  46.24 
 
 
272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  43.66 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.81 
 
 
297 aa  211  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 
271 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
271 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  43.19 
 
 
271 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  43.19 
 
 
267 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  43.19 
 
 
267 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
298 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
279 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
315 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.24 
 
 
341 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.95 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.78 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.06 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.26 
 
 
368 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.12 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.26 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5853  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.77 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.62 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.07 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  24.91 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  24.18 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.61 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  24.18 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  24.18 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  24.18 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.54 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  26.85 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.63 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
290 aa  72  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  25.5 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.02 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.63 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.63 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  23.68 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  25.55 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.35 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.55 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>