84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0990 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  41.43 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  35.96 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  34.39 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  34.15 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  32.63 
 
 		 339 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  36.21 
 
 		 352 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  29.86 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  33.82 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  37.89 
 
 		 374 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  30.88 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  30.77 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  30.68 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  28.39 
 
 		 343 aa  89.4  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  27.71 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.03 
 
 		 546 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.78 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  29.41 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  21.09 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  28.38 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  26.38 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  28.38 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  25.89 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  25.11 
 
 		 545 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  28.38 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  28.96 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  25.53 
 
 		 605 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  25.98 
 
 		 572 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  29.06 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  31.39 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  29.73 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  27.45 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  29.06 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  25.48 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  26.72 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  27.36 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  31.82 
 
 		 567 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.4 
 
 		 600 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  33.82 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.48 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.4 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  24.26 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  23.87 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25.55 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  25.11 
 
 		 347 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.39 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.65 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  37.27 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  25.55 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  26.48 
 
 		 533 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  26.34 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  25.76 
 
 		 345 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  26.11 
 
 		 336 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  35.24 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.09 
 
 		 565 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  23.99 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  30.43 
 
 		 410 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  37.5 
 
 		 146 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  31.1 
 
 		 551 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  23.83 
 
 		 380 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  29.63 
 
 		 464 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  28.7 
 
 		 300 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  26.29 
 
 		 569 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  26.62 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  25.5 
 
 		 449 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  34.38 
 
 		 410 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  32.58 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  25.53 
 
 		 526 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1960  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.14 
 
 		 610 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.317631  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.05 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  32.38 
 
 		 430 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  27.03 
 
 		 449 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.05 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  35 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  35.24 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  26.49 
 
 		 433 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>