269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0946 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.43 
 
 		 872 aa  1090    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  66.51 
 
 		 871 aa  1115    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  64.43 
 
 		 856 aa  1058    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  67.54 
 
 		 867 aa  1138    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  62.13 
 
 		 944 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  65.63 
 
 		 863 aa  1101    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  65.35 
 
 		 899 aa  1046    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  67.96 
 
 		 881 aa  1094    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  65 
 
 		 859 aa  1091    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  50.9 
 
 		 792 aa  716    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.39 
 
 		 875 aa  1098    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  48.23 
 
 		 779 aa  679    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  51.45 
 
 		 811 aa  716    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  71.39 
 
 		 838 aa  1126    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  65.01 
 
 		 859 aa  1061    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  67.28 
 
 		 884 aa  1074    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  49.7 
 
 		 800 aa  746    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  94.38 
 
 		 836 aa  1586    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  67.67 
 
 		 857 aa  1124    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  63.42 
 
 		 842 aa  1057    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  66.42 
 
 		 852 aa  1118    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  64.8 
 
 		 841 aa  1067    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  65 
 
 		 859 aa  1091    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  65.49 
 
 		 859 aa  1068    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  100 
 
 		 860 aa  1736    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  48.25 
 
 		 826 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  69.52 
 
 		 859 aa  1169    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  65.24 
 
 		 859 aa  1095    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  42.5 
 
 		 841 aa  592  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  46.4 
 
 		 757 aa  572  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  65.04 
 
 		 416 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  66.32 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.65 
 
 		 737 aa  439  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  53.1 
 
 		 820 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  47.72 
 
 		 392 aa  357  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  49.7 
 
 		 429 aa  350  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  49.58 
 
 		 418 aa  346  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  51.8 
 
 		 380 aa  345  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  48.58 
 
 		 435 aa  343  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  49.86 
 
 		 386 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  48.48 
 
 		 376 aa  308  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  43.27 
 
 		 359 aa  308  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  44.87 
 
 		 359 aa  308  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  44.57 
 
 		 370 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  48.09 
 
 		 453 aa  305  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  43.99 
 
 		 359 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  42.73 
 
 		 352 aa  298  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  42.69 
 
 		 362 aa  296  9e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 390 aa  296  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  43.43 
 
 		 380 aa  295  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  41.28 
 
 		 419 aa  295  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  41.45 
 
 		 352 aa  294  6e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  43.12 
 
 		 352 aa  291  3e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 		 358 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  45.65 
 
 		 329 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  42.02 
 
 		 351 aa  282  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  45.66 
 
 		 565 aa  282  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.78 
 
 		 382 aa  282  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  44.06 
 
 		 381 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.52 
 
 		 419 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  45.57 
 
 		 356 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46.57 
 
 		 331 aa  272  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.56 
 
 		 741 aa  271  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 367 aa  271  5e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  42.51 
 
 		 384 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  41.5 
 
 		 391 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  42.9 
 
 		 325 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  41.49 
 
 		 384 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  41.49 
 
 		 384 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.45 
 
 		 737 aa  267  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  40.18 
 
 		 358 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  41.44 
 
 		 365 aa  262  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  40.39 
 
 		 398 aa  261  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  39.23 
 
 		 366 aa  260  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  45.35 
 
 		 327 aa  260  7e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  38.81 
 
 		 376 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  42.82 
 
 		 386 aa  257  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 		 362 aa  254  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  42.39 
 
 		 330 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  39.88 
 
 		 358 aa  253  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  38.11 
 
 		 356 aa  248  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  41.62 
 
 		 321 aa  247  6e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  39.1 
 
 		 362 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  39.88 
 
 		 358 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.73 
 
 		 393 aa  244  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  45.91 
 
 		 387 aa  242  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  43.03 
 
 		 326 aa  243  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  38.52 
 
 		 372 aa  241  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.77 
 
 		 389 aa  241  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  39.12 
 
 		 364 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  44.41 
 
 		 368 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  35.89 
 
 		 361 aa  232  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 362 aa  232  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  38.89 
 
 		 360 aa  228  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  42.21 
 
 		 355 aa  227  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  38.83 
 
 		 349 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  35.8 
 
 		 361 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 355 aa  222  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  41.93 
 
 		 372 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 358 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>