66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0928 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  40.76 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  45.64 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  46.41 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  30.93 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  33.65 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  31.7 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  43.87 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  43.88 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  35.32 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  30.58 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  38.55 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  42.58 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  30.97 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  34.03 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  37.5 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  38.69 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  38.24 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  38.24 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  38.69 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  32.55 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  34.88 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  38.69 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  37.27 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  37.41 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  32.81 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  37.11 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  37.67 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  30.05 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  35.46 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  30.36 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  31.58 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  34.36 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  28.1 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  31.43 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  30.3 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  29.94 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  34.4 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  30.46 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  34.35 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  32.29 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  32.67 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  28.86 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  32.06 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  29.88 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  29.66 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  26.79 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  26.53 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2842  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30 
 
 		 824 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.79 
 
 		 795 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2067  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.38 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.42 
 
 		 807 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0870176  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2315  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 803 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507205  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1829  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.46 
 
 		 795 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000186413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 		 433 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.46 
 
 		 795 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.78 
 
 		 816 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1971  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.41 
 
 		 800 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.46 
 
 		 795 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.46 
 
 		 795 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.46 
 
 		 795 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2408  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 		 830 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.46 
 
 		 795 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.03 
 
 		 854 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1142  hypothetical protein  24.88 
 
 		 225 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.73 
 
 		 795 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.188862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>