More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0917 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.93 
 
 
601 aa  798    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  64.92 
 
 
599 aa  774    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.32 
 
 
589 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  54.3 
 
 
590 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.56 
 
 
600 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.96 
 
 
621 aa  740    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.85 
 
 
590 aa  697    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
594 aa  1198    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  57.34 
 
 
589 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.96 
 
 
590 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  57.34 
 
 
589 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  55.48 
 
 
590 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.01 
 
 
591 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.93 
 
 
601 aa  798    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  57.5 
 
 
589 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.38 
 
 
596 aa  774    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.6 
 
 
593 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  66.27 
 
 
593 aa  810    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.6 
 
 
601 aa  795    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  95.79 
 
 
594 aa  1155    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  59.87 
 
 
591 aa  716    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2910  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  66.78 
 
 
594 aa  799    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  68.52 
 
 
594 aa  830    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  61.89 
 
 
590 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.94 
 
 
593 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  64.93 
 
 
601 aa  798    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  58.01 
 
 
592 aa  702    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.71 
 
 
591 aa  733    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  59.86 
 
 
569 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  61.38 
 
 
590 aa  733    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.92 
 
 
598 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  56.83 
 
 
589 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  63.8 
 
 
594 aa  783    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.44 
 
 
601 aa  801    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.31 
 
 
589 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.72 
 
 
593 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  54.18 
 
 
595 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  54.18 
 
 
595 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.86 
 
 
595 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  54.18 
 
 
595 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.85 
 
 
595 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  52.39 
 
 
589 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19370  putative asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  52.22 
 
 
589 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826487  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.58 
 
 
590 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  54.05 
 
 
588 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  51.68 
 
 
594 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  50 
 
 
598 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.49 
 
 
610 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  47.67 
 
 
602 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  49.83 
 
 
592 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.91 
 
 
628 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.54 
 
 
638 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.34 
 
 
625 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  36.26 
 
 
643 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.98 
 
 
637 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.16 
 
 
635 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.13 
 
 
619 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.85 
 
 
610 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.32 
 
 
631 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.68 
 
 
632 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.45 
 
 
646 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.91 
 
 
619 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.5 
 
 
632 aa  290  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.11 
 
 
629 aa  289  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.93 
 
 
629 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.07 
 
 
641 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.85 
 
 
629 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.27 
 
 
592 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  32.13 
 
 
637 aa  286  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.97 
 
 
637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.9 
 
 
634 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.75 
 
 
627 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.49 
 
 
633 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.89 
 
 
641 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.16 
 
 
625 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.81 
 
 
622 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.68 
 
 
658 aa  277  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.79 
 
 
606 aa  276  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.3 
 
 
621 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.28 
 
 
643 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.7 
 
 
633 aa  272  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.82 
 
 
645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.42 
 
 
649 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  30.19 
 
 
632 aa  270  7e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  33.23 
 
 
642 aa  270  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.22 
 
 
633 aa  269  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.32 
 
 
634 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.06 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  31.06 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  31.06 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.06 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  29.87 
 
 
632 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.06 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.06 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.44 
 
 
631 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.06 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.34 
 
 
647 aa  267  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.19 
 
 
639 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  31.8 
 
 
626 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.58 
 
 
603 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>