76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0910 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  100 
 
 
361 aa  698    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  89.47 
 
 
361 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  55.02 
 
 
348 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  57.88 
 
 
343 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  53.1 
 
 
329 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  54.79 
 
 
376 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  56.3 
 
 
324 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  54.72 
 
 
340 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  49.83 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  47.1 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  47.11 
 
 
305 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  50.61 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.77 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  43.77 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  43.4 
 
 
318 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  44.86 
 
 
320 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  45.9 
 
 
320 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  45.83 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  44.22 
 
 
348 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  43.98 
 
 
314 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  44.68 
 
 
368 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  50 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  50.52 
 
 
270 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  42.78 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  29 
 
 
244 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.29 
 
 
219 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.16 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.09 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.09 
 
 
244 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.09 
 
 
244 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.09 
 
 
244 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.09 
 
 
244 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  35.09 
 
 
267 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  36.46 
 
 
207 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.47 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  37.35 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  32.18 
 
 
296 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  32.17 
 
 
255 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  32.86 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  33.87 
 
 
235 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  35.55 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  35.54 
 
 
240 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  33.87 
 
 
235 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.7 
 
 
238 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  33.66 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  25.98 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  32.79 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.8 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  38.28 
 
 
235 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  32.97 
 
 
240 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  21.83 
 
 
196 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  31.55 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  32.97 
 
 
240 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  21.83 
 
 
197 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.9 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  34.52 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  21.83 
 
 
197 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2308  GDSL family lipase/acylhydrolase  24.43 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  21.65 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1718  lipolytic protein G-D-S-L family  29.41 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  21.83 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  32.5 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  30.73 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  29.92 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.14 
 
 
216 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  21.83 
 
 
197 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.67 
 
 
267 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  21.32 
 
 
197 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  26.19 
 
 
213 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  29.68 
 
 
261 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  31.76 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  28.64 
 
 
326 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  24.63 
 
 
206 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  27.47 
 
 
242 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  34.09 
 
 
264 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
223 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>