More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0894 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
314 aa  609  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  89.46 
 
 
313 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  65.62 
 
 
323 aa  352  7e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  63.02 
 
 
321 aa  345  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  61.39 
 
 
311 aa  334  9e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  60.97 
 
 
318 aa  328  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  57.98 
 
 
319 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  55.77 
 
 
312 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  58.41 
 
 
308 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  55.29 
 
 
353 aa  299  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  55.94 
 
 
353 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  56.07 
 
 
326 aa  291  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  53.44 
 
 
331 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  53.65 
 
 
320 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  54.83 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  53.63 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  53.31 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  55.28 
 
 
318 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  56.07 
 
 
319 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  52.68 
 
 
315 aa  268  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  53.48 
 
 
326 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  53.77 
 
 
313 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  50.94 
 
 
318 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  51.56 
 
 
319 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  50.93 
 
 
327 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  50.15 
 
 
328 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  51.89 
 
 
328 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  48.1 
 
 
309 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  48.1 
 
 
309 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  48.1 
 
 
309 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  50.62 
 
 
315 aa  249  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  50.31 
 
 
532 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  50 
 
 
318 aa  245  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  51.09 
 
 
322 aa  245  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  43.43 
 
 
568 aa  235  9e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  44.14 
 
 
333 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13480  Ppx/GppA phosphatase  52.6 
 
 
317 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  47.42 
 
 
308 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  42.9 
 
 
307 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  39.48 
 
 
310 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  35.39 
 
 
305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  40.45 
 
 
310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  41.32 
 
 
305 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  38.99 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  42.31 
 
 
305 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  38.78 
 
 
327 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0658  Ppx/GppA phosphatase  41.67 
 
 
305 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 
301 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  33.01 
 
 
305 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  33.97 
 
 
317 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  35.85 
 
 
312 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  34.48 
 
 
312 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  39.06 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  35.46 
 
 
312 aa  155  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  34.02 
 
 
311 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  34.81 
 
 
311 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
288 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  38.06 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0128  Ppx/GppA phosphatase  33.43 
 
 
347 aa  138  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  34.5 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  35.37 
 
 
311 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  33.44 
 
 
532 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  36.16 
 
 
307 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  32.04 
 
 
557 aa  133  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  32.36 
 
 
550 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  34.28 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03920  exopolyphosphatase  43.01 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.20783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  33.33 
 
 
513 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  28.81 
 
 
300 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  26.43 
 
 
321 aa  127  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  35.31 
 
 
304 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  34.39 
 
 
311 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  37.03 
 
 
300 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  32.04 
 
 
303 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  30.42 
 
 
550 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  35.49 
 
 
399 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  31.87 
 
 
505 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  35.25 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3210  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  32.42 
 
 
375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.89 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  31.82 
 
 
502 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  34.41 
 
 
505 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  31.55 
 
 
545 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0084  Ppx/GppA phosphatase  37.82 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426171  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.42 
 
 
544 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.42 
 
 
544 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  29.84 
 
 
501 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  29.84 
 
 
299 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  30.52 
 
 
544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  36.08 
 
 
300 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  30.1 
 
 
570 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  31.63 
 
 
549 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  30.62 
 
 
539 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  32.79 
 
 
338 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5174  Ppx/GppA phosphatase  30.89 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985402  normal  0.0128836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  29.97 
 
 
535 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>