163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0864 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0864  HAD family hydrolase  100 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0810  HAD family hydrolase  91.58 
 
 		 274 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4324  trehalose-phosphatase  41.98 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.0213832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 1225 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  35.06 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0794  trehalose-phosphatase  37.7 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2971  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  32.94 
 
 		 1186 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 1215 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 1215 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 1215 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.24 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5832  trehalose-phosphatase  35.32 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0179  HAD family hydrolase  31.23 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183714  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3304  trehalose-phosphatase  33.6 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0224  trehalose-phosphatase  33.87 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  34.13 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8924  trehalose-6-phosphatase  33.85 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.568468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  34.62 
 
 		 1327 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  28.51 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0296  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.08 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  32.94 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2827  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0316948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4211  trehalose-phosphatase  31.33 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0840  trehalose-phosphatase  27.08 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  32.41 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  31.17 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  31.17 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.26 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  32.43 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  31.17 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.06 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  32.06 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  34.2 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02610  trehalose-phosphatase, putative  28.57 
 
 		 989 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  33.04 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.34 
 
 		 1314 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  31.6 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  32.13 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3989  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  34.13 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  31.75 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  31.75 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.43 
 
 		 525 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  31.78 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  31.92 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  31.28 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  28.38 
 
 		 867 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  31.28 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2549  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  29.96 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03441  Trehalose-6-phosphate phosphatase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6Y289]  25.33 
 
 		 908 aa  65.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.714188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.05 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  33.47 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  27.95 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  31.9 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5313  HAD family hydrolase  35.23 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  31.22 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31710  trehalose-phosphatase  30.24 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.59 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  34.36 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  30.04 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  30.11 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2714  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  32.51 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  33 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  33 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  31.19 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  31.7 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  31.4 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.04 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  25.51 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.42 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  30.33 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  29.84 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0807  trehalose-phosphatase  33.33 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  32.82 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  30.13 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  30.1 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03830  trehalose-phosphatase  29.17 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.872601  normal  0.0458529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.17 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  28.64 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>