More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0852 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  78.69 
 
 
638 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  100 
 
 
621 aa  1221    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  36.12 
 
 
563 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  58.17 
 
 
411 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  57.09 
 
 
525 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  57.59 
 
 
468 aa  294  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.21 
 
 
659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  54.02 
 
 
596 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  54.37 
 
 
419 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  57.47 
 
 
528 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  47.5 
 
 
776 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  50.75 
 
 
766 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  52.54 
 
 
422 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  52.99 
 
 
632 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  51.72 
 
 
659 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.83 
 
 
531 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  51.34 
 
 
675 aa  266  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.08 
 
 
678 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  54.72 
 
 
470 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  54.96 
 
 
521 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.87 
 
 
562 aa  263  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  50.94 
 
 
674 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
418 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  49.25 
 
 
487 aa  256  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  52.76 
 
 
461 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.25 
 
 
668 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
535 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  47.9 
 
 
631 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  44.3 
 
 
595 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  50.4 
 
 
703 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  49.37 
 
 
377 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  56.4 
 
 
575 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  47.71 
 
 
575 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  52.11 
 
 
705 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  53.03 
 
 
503 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.39 
 
 
446 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  48.68 
 
 
501 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  47.51 
 
 
605 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 
583 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
534 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  47.57 
 
 
855 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  52.26 
 
 
581 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  48.45 
 
 
468 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  49.41 
 
 
553 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  44.03 
 
 
509 aa  228  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  48.64 
 
 
345 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  48.5 
 
 
674 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  45.38 
 
 
525 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  47.83 
 
 
559 aa  225  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  51.09 
 
 
419 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 
571 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  43.32 
 
 
493 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
695 aa  223  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  49.03 
 
 
564 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  50.96 
 
 
673 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  44.69 
 
 
554 aa  220  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.98 
 
 
532 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  47.69 
 
 
460 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  50.22 
 
 
650 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  50.55 
 
 
507 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  50.95 
 
 
532 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  50.8 
 
 
617 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  45.21 
 
 
385 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  47.31 
 
 
296 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
556 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  46.86 
 
 
1029 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  43.82 
 
 
543 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
391 aa  204  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.36 
 
 
405 aa  203  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  45.76 
 
 
501 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  45.05 
 
 
476 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.28 
 
 
512 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  43.35 
 
 
264 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
481 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 
612 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 
660 aa  190  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  43.07 
 
 
493 aa  190  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 
538 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  43.23 
 
 
543 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.97 
 
 
598 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  33.33 
 
 
621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
646 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  39.92 
 
 
692 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  31.85 
 
 
641 aa  178  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 
596 aa  177  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.84 
 
 
627 aa  177  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  42.91 
 
 
482 aa  177  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 
316 aa  177  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
691 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.33 
 
 
1655 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.74 
 
 
579 aa  174  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.74 
 
 
662 aa  173  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.65 
 
 
668 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.85 
 
 
652 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.25 
 
 
653 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.91 
 
 
666 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
612 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  38.01 
 
 
320 aa  171  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>