84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0824 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
301 aa  579  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  84.39 
 
 
301 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  43.09 
 
 
314 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  46.04 
 
 
308 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  45.07 
 
 
314 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  47.23 
 
 
304 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  45.45 
 
 
301 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  43.13 
 
 
297 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  44.53 
 
 
315 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  39.36 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  34.35 
 
 
407 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  42.79 
 
 
314 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  37.59 
 
 
334 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  38.14 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  38.08 
 
 
316 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  38.08 
 
 
316 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  38.08 
 
 
316 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  38.06 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  40.91 
 
 
316 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  42.25 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  38.52 
 
 
311 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  38.02 
 
 
311 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  39.17 
 
 
313 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  33.8 
 
 
316 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  49.64 
 
 
431 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
338 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  35.87 
 
 
314 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  37.65 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  31.89 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  36.11 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  34.81 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  32.99 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  36.52 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  39.34 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  38.05 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  35.91 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  32.25 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  38.6 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  34.84 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  40.22 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  38.58 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  40.22 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  40.22 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  39.13 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  39.13 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  27.86 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  27.86 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  22.91 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  41.3 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  28.03 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  42.17 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  24.69 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  26.52 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  32.97 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0183  hypothetical protein  31.78 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  25 
 
 
270 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  27.18 
 
 
304 aa  45.8  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  24.54 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  24.54 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  24.54 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  24.54 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  23.46 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  23.46 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  35.67 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1945  peptidase M48 Ste24p  39.74 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0762  peptidase M48, Ste24p  41.51 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0736297  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  45.1 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  32.59 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  35.67 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  44.64 
 
 
319 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  36.9 
 
 
383 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  25.81 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  31.41 
 
 
328 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  32.52 
 
 
283 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  32.04 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>