More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0787 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  92 
 
 		 227 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  79.19 
 
 		 215 aa  330  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  68.5 
 
 		 200 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  69.04 
 
 		 205 aa  291  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  69.9 
 
 		 221 aa  288  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  64.65 
 
 		 218 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  67.66 
 
 		 216 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  68.02 
 
 		 207 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  65.5 
 
 		 330 aa  272  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  61.95 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  61.65 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 212 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  62.07 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 212 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 212 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 197 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 197 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  65.98 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 218 aa  257  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  62.07 
 
 		 271 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  59.22 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  60.3 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  61.22 
 
 		 205 aa  248  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  58 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 204 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  57.95 
 
 		 199 aa  224  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 273 aa  218  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  55.93 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  29.9 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  35.04 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  27.6 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  40 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  28.96 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>