More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0782 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
289 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  93.77 
 
 
289 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  72.2 
 
 
298 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  72.04 
 
 
316 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  67.27 
 
 
281 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  70.61 
 
 
284 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  67.74 
 
 
288 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  66.67 
 
 
293 aa  318  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  65.83 
 
 
281 aa  315  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  61.51 
 
 
302 aa  309  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  64.31 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  63.31 
 
 
305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  64.52 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  64 
 
 
295 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  65.49 
 
 
300 aa  299  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  67.38 
 
 
287 aa  298  9e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  64.34 
 
 
307 aa  297  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  63.35 
 
 
290 aa  295  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  63.64 
 
 
320 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  65.25 
 
 
310 aa  289  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  53.77 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  55.47 
 
 
294 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  55.47 
 
 
294 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  54.01 
 
 
314 aa  278  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  55.11 
 
 
294 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  54.01 
 
 
311 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  59.64 
 
 
600 aa  276  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  64.75 
 
 
324 aa  275  8e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  53.98 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  52.52 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  61.89 
 
 
303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  63.25 
 
 
306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0906  dimethyladenosine transferase  66.55 
 
 
288 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00888376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  58.3 
 
 
295 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0767  dimethyladenosine transferase  63.23 
 
 
291 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  53.24 
 
 
290 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  57.19 
 
 
319 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3964  dimethyladenosine transferase  63.14 
 
 
251 aa  222  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 
293 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  42.47 
 
 
264 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
292 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
284 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  38.63 
 
 
291 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.99 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  38.16 
 
 
292 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  44.16 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  43.51 
 
 
274 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  42.16 
 
 
296 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  32.99 
 
 
305 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
290 aa  176  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  35.51 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
290 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  34.42 
 
 
295 aa  169  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  42.15 
 
 
267 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  36.27 
 
 
301 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  45.53 
 
 
262 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 
299 aa  168  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  40.66 
 
 
288 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 
272 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 
271 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  40.77 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
297 aa  165  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  38.08 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  35.87 
 
 
297 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  35.87 
 
 
297 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  42.47 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  32.72 
 
 
291 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 
257 aa  162  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
273 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  39.59 
 
 
297 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 
268 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 
285 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  35.48 
 
 
292 aa  159  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 
296 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 
271 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  38.97 
 
 
284 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
270 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 
272 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  41.73 
 
 
262 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  36.74 
 
 
264 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
275 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>