66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0778 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  85.97 
 
 
560 aa  908    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
579 aa  1140    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  50.28 
 
 
508 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  41.84 
 
 
553 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  42.43 
 
 
539 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  40.63 
 
 
528 aa  361  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  40.7 
 
 
547 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  43.39 
 
 
531 aa  355  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  40.39 
 
 
534 aa  353  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  39.56 
 
 
573 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  41.73 
 
 
569 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 
586 aa  343  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  40.73 
 
 
520 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  42 
 
 
539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 
567 aa  337  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  40.1 
 
 
544 aa  336  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  40.21 
 
 
638 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  38.83 
 
 
584 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.17 
 
 
538 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.47 
 
 
511 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 
516 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
541 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 
493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 
525 aa  306  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 
493 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 
493 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  36.83 
 
 
523 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  37.24 
 
 
559 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  40.11 
 
 
537 aa  292  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  36.41 
 
 
592 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  38.42 
 
 
522 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  36.71 
 
 
555 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.24 
 
 
541 aa  280  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  36 
 
 
585 aa  273  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  34.52 
 
 
572 aa  266  8.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  39.82 
 
 
507 aa  264  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  37.54 
 
 
563 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  33.2 
 
 
534 aa  237  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  34.82 
 
 
528 aa  237  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  20.82 
 
 
658 aa  107  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  26.67 
 
 
441 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  25.21 
 
 
469 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 
487 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  25.79 
 
 
462 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  25.05 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.33 
 
 
447 aa  94.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  25.32 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  22.05 
 
 
493 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  27.1 
 
 
566 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  23.42 
 
 
492 aa  87.8  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
968 aa  87  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  24.19 
 
 
767 aa  75.1  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  27.86 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 
918 aa  64.7  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
439 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90238  predicted protein  27.16 
 
 
821 aa  60.5  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  28.7 
 
 
918 aa  57.4  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  22.78 
 
 
745 aa  54.3  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72313  predicted protein  29.66 
 
 
758 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502969  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57202  predicted protein  27.37 
 
 
739 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0669356  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01459  mannosyltransferase PMTI (AFU_orthologue; AFUA_8G04500)  24.78 
 
 
773 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.97174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0362  glycosyl transferase family 39  34.72 
 
 
475 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70572  Phospho Mannno Transferase; dolichyl-P-mannose-protein mannosyltransferase  27.06 
 
 
759 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0562818  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  28.75 
 
 
532 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05105  Dolichyl-phosphate-mannose:protein mannosyltransferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WN5]  23.89 
 
 
740 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00465625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>