More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0730 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  94.92 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  67.8 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  68.7 
 
 		 117 aa  173  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  68.14 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  61.02 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  63.56 
 
 		 125 aa  167  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  65.25 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  64.35 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  65.22 
 
 		 131 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  64.35 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  61.67 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  61.21 
 
 		 121 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  60.17 
 
 		 124 aa  159  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  60 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  61.74 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  62.71 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  59.17 
 
 		 120 aa  157  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  60.34 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  61.21 
 
 		 123 aa  157  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  60.17 
 
 		 123 aa  157  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  62.39 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  62.71 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  59.48 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  59.13 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  59.48 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  59.48 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  64.41 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  62.61 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  57.63 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  58.62 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  61.54 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  58.41 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  53.33 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  53.33 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  56.9 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  59.13 
 
 		 126 aa  149  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  57.39 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  58.26 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  56.03 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  58.47 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  54.24 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  58.04 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  58.47 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  56.03 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  54.24 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  56.88 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  49.57 
 
 		 123 aa  137  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  50.82 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  57.41 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  51.3 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  55.05 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  59.63 
 
 		 120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  50 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  58.72 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  57.8 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  57.8 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  55.05 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  51.69 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  57.8 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  42.48 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  42.48 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  41.03 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  41.03 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  44.55 
 
 		 113 aa  110  9e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  50 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  40.17 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  48.51 
 
 		 178 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  49.02 
 
 		 170 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  49.02 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  49.02 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  44.64 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  45.63 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  47.06 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  47.06 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  47.06 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  48.54 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  51.49 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  46.08 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  40.95 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  42.16 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  43.88 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  46.08 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  42.57 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  42.39 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  47 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  45.19 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  45 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  41.03 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  47.06 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  44 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  43 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  41 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  41 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  40 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  40 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  41 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  40 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>