More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0723 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  100 
 
 		 318 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  95.6 
 
 		 318 aa  621  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  82.64 
 
 		 321 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  79.42 
 
 		 338 aa  504  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  77.24 
 
 		 316 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  77.2 
 
 		 321 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  78.14 
 
 		 317 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  75.64 
 
 		 313 aa  474  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  77.49 
 
 		 319 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  72.52 
 
 		 313 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  70.19 
 
 		 312 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  68.37 
 
 		 315 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  67.19 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  66.56 
 
 		 336 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  66.56 
 
 		 327 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  66.56 
 
 		 327 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  65.61 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  64.67 
 
 		 319 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  63.58 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  57.05 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  47.78 
 
 		 325 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  44.52 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  45.51 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  45.52 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  43.61 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  43.48 
 
 		 331 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  43.31 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  42.63 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  45.89 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  42.36 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  42.9 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  42.32 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  42.32 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  44.08 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  42.55 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  41.88 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  41.75 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  40.66 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  43.91 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  41.48 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  40.58 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  43.72 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  41.39 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  39.55 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  40.73 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  40.73 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  37.17 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  42.05 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  34.01 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 		 363 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  33.55 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  33.68 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  33.87 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  33.68 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  34.64 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  34.11 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  33.56 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  31.96 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  32.77 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  32.54 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  33.92 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  34.27 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  34.24 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  34.39 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  34.97 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  34.88 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  33.1 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  33.1 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  32.74 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  34.98 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.92 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.92 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.92 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.92 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  33.68 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  32.96 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  32.04 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  33.77 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  33.55 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.57 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  33.1 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  31.25 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  32.55 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  34.18 
 
 		 285 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  32.38 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  37.98 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  32.63 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  32.37 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  33.45 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  32.39 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  31.69 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  32.78 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.96 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  32.39 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  37.21 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  30.59 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  31.49 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>