110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0721 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  89.63 
 
 
319 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  45.79 
 
 
306 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.97 
 
 
286 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.82 
 
 
317 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.46 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  37.71 
 
 
305 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  40.49 
 
 
304 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.45 
 
 
302 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 
300 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  36.13 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  34.39 
 
 
302 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 
305 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
302 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  28.77 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  29.12 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  29.12 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  29.66 
 
 
286 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  29.12 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  29.12 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  31.95 
 
 
308 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.68 
 
 
293 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  32.9 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  34.93 
 
 
310 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  32.82 
 
 
283 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
288 aa  116  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.1 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.01 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  27.21 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.01 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  28.91 
 
 
295 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.02 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  28.32 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  36.95 
 
 
285 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  34.53 
 
 
316 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  27.09 
 
 
295 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.19 
 
 
307 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  33.07 
 
 
296 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  42.5 
 
 
277 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  36.59 
 
 
285 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  28.57 
 
 
300 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  28.72 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  28.32 
 
 
297 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  28.22 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  37.59 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.6 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  27.18 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.83 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.83 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  26.83 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.83 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.83 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  26.83 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  30.21 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  34.68 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.83 
 
 
303 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  27.46 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  26.13 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  37.5 
 
 
318 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  30.9 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  21.99 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  30.43 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  32.83 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  24.19 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.04 
 
 
288 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  24.4 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  29.41 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  31.48 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  24.27 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  28.31 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  32.68 
 
 
330 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  31.71 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 
315 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  28.28 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0625  hypothetical protein  30.51 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  28.97 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.91 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.63 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  23.73 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.17 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4399  hypothetical protein  24.92 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  25.64 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.32 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  31.84 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>