More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0710 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0710  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  100 
 
 
488 aa  937    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0657  leucyl aminopeptidase  86.07 
 
 
488 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0633269  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0789  Leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 
455 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  47.58 
 
 
491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  50 
 
 
479 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1104  Leucyl aminopeptidase  48.13 
 
 
503 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  45.47 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  45.07 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  44.76 
 
 
616 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1149  Leucyl aminopeptidase  50.38 
 
 
516 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.901079  normal  0.0342275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2924  Leucyl aminopeptidase  45.04 
 
 
524 aa  293  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  47.62 
 
 
505 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  44.34 
 
 
497 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1834  leucyl aminopeptidase  44.24 
 
 
502 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1032  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25920  leucyl aminopeptidase  47.51 
 
 
527 aa  279  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118194  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.58 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.78 
 
 
492 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  42.96 
 
 
508 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  44.1 
 
 
490 aa  273  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3836  leucyl aminopeptidase  43.66 
 
 
575 aa  273  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0130732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0809  Leucyl aminopeptidase  39.44 
 
 
537 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1207  leucyl aminopeptidase  44.01 
 
 
527 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  44.25 
 
 
503 aa  269  8e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  41.98 
 
 
515 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  42.23 
 
 
507 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  41.16 
 
 
497 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  43.87 
 
 
482 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  44.74 
 
 
503 aa  259  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  38.71 
 
 
528 aa  257  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  38.15 
 
 
503 aa  256  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3321  leucyl aminopeptidase  40.47 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3310  leucyl aminopeptidase  40.59 
 
 
513 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3372  leucyl aminopeptidase  40.59 
 
 
513 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.183674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.07 
 
 
488 aa  253  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  37.47 
 
 
496 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1004  Leucyl aminopeptidase  47.98 
 
 
531 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
511 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1125  Leucyl aminopeptidase  36.1 
 
 
491 aa  250  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.013782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  45.5 
 
 
505 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  39.69 
 
 
462 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  42.54 
 
 
507 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12241  leucyl aminopeptidase  42.62 
 
 
515 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.299314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  38.33 
 
 
487 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 
495 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 
495 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  38.29 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3575  leucyl aminopeptidase  43.97 
 
 
510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00437007  normal  0.0600752 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  32.79 
 
 
488 aa  242  9e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13310  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 
510 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0623814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2938  leucyl aminopeptidase  44.41 
 
 
505 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  43.74 
 
 
492 aa  239  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  39 
 
 
497 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  40.05 
 
 
495 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  37.67 
 
 
511 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  35.38 
 
 
496 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  35.86 
 
 
501 aa  236  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  39.91 
 
 
496 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  39.09 
 
 
508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  42.45 
 
 
498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1874  Leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 
497 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219143  normal  0.0871837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  39.14 
 
 
496 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1271  leucyl aminopeptidase  41.04 
 
 
502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.609468  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  39.47 
 
 
502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
497 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  42.72 
 
 
556 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  34.54 
 
 
496 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2108  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 
489 aa  232  9e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
497 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  40.61 
 
 
483 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  39.36 
 
 
487 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  36.75 
 
 
497 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  40.61 
 
 
483 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  39.04 
 
 
488 aa  230  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  34.56 
 
 
493 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2029  Leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
499 aa  230  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0427313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  34.06 
 
 
493 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 
474 aa  229  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  42.73 
 
 
545 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1834  leucyl aminopeptidase  45.65 
 
 
506 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  38.31 
 
 
496 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  36.11 
 
 
496 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  37.09 
 
 
514 aa  227  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4388  Leucyl aminopeptidase  46.69 
 
 
490 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  38.1 
 
 
496 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  41.71 
 
 
476 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  38.6 
 
 
530 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  38.33 
 
 
497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  31.65 
 
 
493 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  37.65 
 
 
498 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  37.97 
 
 
488 aa  226  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  39.87 
 
 
502 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  37.56 
 
 
500 aa  226  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  39.29 
 
 
518 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  38.15 
 
 
489 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1430  leucyl aminopeptidase  34.66 
 
 
490 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13861  leucyl aminopeptidase  34.98 
 
 
493 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0993846  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  39.37 
 
 
502 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  38.55 
 
 
503 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
502 aa  225  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>