More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0665 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 405 aa  825    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  44.2 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  32.58 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  40.56 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  39.72 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  35.46 
 
 		 310 aa  97.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  45 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 		 300 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 299 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 		 300 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.69 
 
 		 461 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 		 289 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 		 308 aa  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  39.86 
 
 		 302 aa  87.4  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  46.15 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  38.17 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  36.23 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 291 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  39.32 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  38.39 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  34.33 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  40.52 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  37.93 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  37.12 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  37.12 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  36.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  38.81 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  37.1 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  43.14 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  43.14 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  43.14 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  44.04 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  32.2 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.71 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  28.62 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  36.84 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.05 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  33.04 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 289 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  36.22 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  32.54 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 927 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.93 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  41.28 
 
 		 861 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.92 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  35.54 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.67 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  37.38 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>