More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0664 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  83.4 
 
 		 250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  48.58 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  42.29 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 343 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.56 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.9 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  30.71 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 343 aa  75.1  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  33.76 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.68 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  25.68 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.88 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>