More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0656 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  825    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  74.65 
 
 
426 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  62.62 
 
 
411 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  48.44 
 
 
434 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  40.05 
 
 
432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 
420 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  42.82 
 
 
402 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  36.9 
 
 
456 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  43.14 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  41.97 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  37.67 
 
 
418 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  37.67 
 
 
397 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  37.67 
 
 
418 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  37.67 
 
 
418 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  37.67 
 
 
417 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  37.67 
 
 
417 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  37.67 
 
 
397 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  39.85 
 
 
416 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  37.11 
 
 
411 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 
467 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 
418 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 
429 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 
432 aa  186  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 
421 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  38.11 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
461 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  37.77 
 
 
416 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 
442 aa  176  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 
451 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  36.83 
 
 
427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
420 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  38.65 
 
 
402 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  34.84 
 
 
420 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  34.55 
 
 
414 aa  157  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 
401 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  34.74 
 
 
425 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
439 aa  146  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
420 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 
417 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  32.69 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  43.62 
 
 
289 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  32.13 
 
 
414 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
444 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.85 
 
 
431 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
433 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
430 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.48 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  28.1 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.48 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.53 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  28.45 
 
 
408 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  28.45 
 
 
408 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  28.45 
 
 
408 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  28.45 
 
 
408 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  28.57 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  35.06 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  31.35 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.44 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.44 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.01 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.99 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  26.3 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.2 
 
 
414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
417 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.51 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.51 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  32.54 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.51 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.51 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.75 
 
 
406 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  31.69 
 
 
461 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
406 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
414 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  22.44 
 
 
404 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
439 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.27 
 
 
404 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  31.34 
 
 
436 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
441 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.18 
 
 
410 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
420 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
420 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
406 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
433 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  29.57 
 
 
419 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.84 
 
 
362 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
432 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  31.3 
 
 
409 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
432 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
433 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>