41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0607 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  86 
 
 
200 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  56.12 
 
 
224 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  46.07 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 
196 aa  131  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  40.93 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 
201 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  42.63 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
210 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  39.79 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  39.79 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  39.79 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  41.14 
 
 
192 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  40 
 
 
201 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 
223 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 
150 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  28.87 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  26.67 
 
 
142 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 
472 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  30.85 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  35.71 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  34.29 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  34.29 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  34.29 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  34.29 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
207 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 
192 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
171 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 
183 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
243 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>