More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0590 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  100 
 
 		 590 aa  1179    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  58.01 
 
 		 590 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.65 
 
 		 1005 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.95 
 
 		 1090 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.28 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.46 
 
 		 1059 aa  95.5  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.29 
 
 		 445 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1042 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.18 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.05 
 
 		 567 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  29.64 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  27.14 
 
 		 1062 aa  92  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.82 
 
 		 717 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.41 
 
 		 1042 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.06 
 
 		 572 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  29.39 
 
 		 431 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  29.39 
 
 		 430 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.39 
 
 		 430 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  29.39 
 
 		 430 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  29.39 
 
 		 430 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  29.39 
 
 		 430 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  29.39 
 
 		 430 aa  90.5  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  29.39 
 
 		 430 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.41 
 
 		 1040 aa  90.5  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 434 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.35 
 
 		 443 aa  89.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  29.69 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.09 
 
 		 421 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  30.18 
 
 		 428 aa  89.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.91 
 
 		 407 aa  89  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.31 
 
 		 427 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 428 aa  88.6  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 435 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  28.19 
 
 		 442 aa  87.8  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.11 
 
 		 407 aa  87.4  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  27.43 
 
 		 437 aa  87.4  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  27.43 
 
 		 440 aa  87.4  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  27.75 
 
 		 430 aa  87  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  27.75 
 
 		 430 aa  87  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  27.75 
 
 		 430 aa  87  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  29.69 
 
 		 428 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  28 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  28.44 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  28 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  26.87 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  26.25 
 
 		 1014 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  33.1 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.49 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  26.43 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  27.56 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  28.63 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.87 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.28 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  27.75 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.27 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  28.82 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  26.56 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.39 
 
 		 1652 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  27.02 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.54 
 
 		 1082 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  26.43 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  25.24 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  27.87 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  27.87 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  30.06 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  26.43 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.29 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  24.78 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  27.75 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  24.2 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  26.94 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  33.33 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.97 
 
 		 1066 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  28.19 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  25.34 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.39 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  26.94 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.34 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.34 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.72 
 
 		 588 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  22.55 
 
 		 1062 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  28.63 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.57 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  26.64 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  25.38 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  25.37 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  23.35 
 
 		 1138 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>