More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0568 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 652 aa  1319    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  56.26 
 
 		 671 aa  739    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  38.2 
 
 		 689 aa  316  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  37.32 
 
 		 686 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  36.9 
 
 		 698 aa  303  9e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  33.42 
 
 		 657 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 373 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  33.5 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.58 
 
 		 357 aa  179  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 		 500 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.01 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 		 421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  31.2 
 
 		 395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  30.82 
 
 		 452 aa  163  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  31.17 
 
 		 492 aa  163  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.12 
 
 		 431 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.47 
 
 		 434 aa  161  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 		 474 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  28.83 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  31.83 
 
 		 420 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 		 424 aa  147  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  31.04 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  32.06 
 
 		 431 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  32.75 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  26.73 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.55 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  31.87 
 
 		 358 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.84 
 
 		 406 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 		 440 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 		 440 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.97 
 
 		 415 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 		 371 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 		 342 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 		 415 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 		 406 aa  135  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  28.53 
 
 		 352 aa  135  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.46 
 
 		 375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.67 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  24.93 
 
 		 360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 		 365 aa  134  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 		 423 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  31.15 
 
 		 429 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.45 
 
 		 340 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 		 354 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 		 508 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  26.32 
 
 		 520 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 468 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  29.38 
 
 		 440 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  31.08 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.41 
 
 		 313 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  33.04 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.05 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  30.55 
 
 		 355 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.52 
 
 		 373 aa  127  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  26.45 
 
 		 464 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  31.53 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 		 365 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  24.58 
 
 		 438 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 		 399 aa  123  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 		 362 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.98 
 
 		 350 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 335 aa  122  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 337 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.54 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 		 328 aa  119  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 		 319 aa  118  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.23 
 
 		 361 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 355 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 		 366 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.58 
 
 		 359 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.73 
 
 		 404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 		 371 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  24.37 
 
 		 323 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.49 
 
 		 381 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.22 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 		 385 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 		 349 aa  114  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 		 310 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 		 313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 		 377 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  27.56 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  30.24 
 
 		 318 aa  112  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 412 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 419 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 		 335 aa  108  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  34.95 
 
 		 334 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 		 434 aa  107  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  27.56 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.22 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>