116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0528 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3067  hypothetical protein  46.43 
 
 		 200 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4582  hypothetical protein  46.43 
 
 		 200 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.90708  decreased coverage  0.000189662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3894  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.58 
 
 		 245 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5197  hypothetical protein  42.07 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5089  hypothetical protein  37.8 
 
 		 170 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3530  hypothetical protein  38.37 
 
 		 250 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.22 
 
 		 306 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.86 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.46 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.64 
 
 		 762 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  34.67 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.94 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.21 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  39.66 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  42.45 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.05 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  39.82 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  36.13 
 
 		 438 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.88 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.09 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.04 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.2 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  36.84 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.01 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.81 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  35.33 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  32.74 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.45 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.45 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.45 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  37.84 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.53 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  36.75 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.61 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.25 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.07 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.53 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  36.75 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.16 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.84 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  37.29 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.04 
 
 		 974 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.33 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  34.23 
 
 		 2277 aa  59.3  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  36.7 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19610  negative regulator of beta-lactamase expression  46.27 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.21 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  40.35 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 575 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.76 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.77 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  35.19 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  60 
 
 		 128 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.29 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 160 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.43 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.85 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  50 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  62.86 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  29.32 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.39 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.91 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 		 508 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.17 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.29 
 
 		 77 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  43.55 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.16 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  60 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 234 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  42.86 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  45.28 
 
 		 204 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 635 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 629 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  45.61 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 1089 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.8 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.09 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  39.51 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  62.16 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  65.71 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.53 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>