21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0505 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  229  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  71.17 
 
 		 464 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  72.07 
 
 		 283 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  66.37 
 
 		 454 aa  159  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  67.26 
 
 		 456 aa  157  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  66.37 
 
 		 456 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  61.95 
 
 		 433 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  59.65 
 
 		 454 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  54.46 
 
 		 492 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  54.13 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  62.07 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  50 
 
 		 477 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  46.4 
 
 		 459 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  47.32 
 
 		 226 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  51.69 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  45.74 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  35.09 
 
 		 470 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  50.82 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  29.52 
 
 		 356 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.29 
 
 		 431 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2523  Bbp50  36.17 
 
 		 69 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>