More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0356 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 455 aa  878    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  89.23 
 
 		 455 aa  750    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  53.66 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  49.68 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  52.63 
 
 		 438 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  49.89 
 
 		 445 aa  359  7e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  50.11 
 
 		 447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  50.11 
 
 		 447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  50.11 
 
 		 447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  50.23 
 
 		 455 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  51.24 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  49.89 
 
 		 456 aa  350  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  49.55 
 
 		 443 aa  349  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  48.83 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  47.15 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  48.88 
 
 		 440 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  48.96 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  43.71 
 
 		 477 aa  332  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  45.55 
 
 		 473 aa  323  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  50.93 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  46.72 
 
 		 430 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  42.89 
 
 		 501 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  45.05 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  39.24 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 		 443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 444 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  36.38 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  41.16 
 
 		 436 aa  279  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  44.55 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  40.55 
 
 		 446 aa  269  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 		 434 aa  266  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.81 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  36.38 
 
 		 436 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  36.02 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  37.05 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  38.91 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.64 
 
 		 441 aa  255  9e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.52 
 
 		 443 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  36.47 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 		 414 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  42.28 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.56 
 
 		 420 aa  240  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 421 aa  239  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  38.21 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.91 
 
 		 461 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 428 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.08 
 
 		 429 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 		 431 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  38.93 
 
 		 440 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  34.25 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 464 aa  222  9e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  37.37 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  31.48 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  36.85 
 
 		 418 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  31.76 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  31.41 
 
 		 450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  35.06 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  33.96 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  32.63 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 439 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  34.18 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  36.17 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>