More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0354 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  82.65 
 
 		 438 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 438 aa  859    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  52.51 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  37.83 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  39.55 
 
 		 452 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 447 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  37.62 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  36.16 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  47.46 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  35.39 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  37.32 
 
 		 476 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 492 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.26 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  41.61 
 
 		 463 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 444 aa  170  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 586 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  46.98 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  33.33 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  34.12 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  32.18 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.39 
 
 		 403 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.57 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  34.45 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  46.25 
 
 		 412 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 624 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 375 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  49.75 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  33.49 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  46.88 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  34.26 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 466 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  47.96 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  41.81 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.41 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 343 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  36.73 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.09 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  40.22 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  39.83 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  33.1 
 
 		 446 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 621 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.62 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  42.29 
 
 		 429 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  43.3 
 
 		 580 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  37.27 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  37.22 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 422 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  40.55 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 725 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 382 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  42.79 
 
 		 374 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2074  signal transduction histidine kinase-like protein  39.9 
 
 		 237 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  38.36 
 
 		 237 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 470 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 576 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  38.62 
 
 		 650 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 775 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  33.47 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  39.15 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27380  hypothetical protein  33.18 
 
 		 262 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  31.22 
 
 		 223 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  36.92 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  32.73 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  35.83 
 
 		 686 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 487 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  34.43 
 
 		 689 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  35.86 
 
 		 664 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>