More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0301 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 263 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  45.91 
 
 		 1033 aa  128  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  40.89 
 
 		 449 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.43 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.6 
 
 		 521 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.85 
 
 		 309 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.71 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.26 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.58 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  44.05 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.04 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  38.62 
 
 		 381 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.28 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  37.78 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  39.71 
 
 		 214 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  43.45 
 
 		 199 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.47 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  46.72 
 
 		 180 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  46.94 
 
 		 291 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.76 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  46.94 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  44.9 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  44.78 
 
 		 576 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  44.05 
 
 		 216 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  41.04 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  39.77 
 
 		 264 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  43.27 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  47.69 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 		 493 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  51.26 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  51.26 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  43.11 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  40.64 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  40.33 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  40.33 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.36 
 
 		 517 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  39.49 
 
 		 446 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 		 489 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  38.34 
 
 		 1191 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  44.37 
 
 		 973 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 		 189 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  40.21 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 		 567 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  45.27 
 
 		 493 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  38.71 
 
 		 450 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  42.5 
 
 		 745 aa  97.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 		 356 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  35.75 
 
 		 600 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 		 401 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 		 401 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  40.23 
 
 		 184 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  40.69 
 
 		 356 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  39.78 
 
 		 483 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35.45 
 
 		 447 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.85 
 
 		 182 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 194 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.26 
 
 		 862 aa  95.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.88 
 
 		 14916 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 		 336 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 		 336 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  37.33 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  45.58 
 
 		 184 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  40.88 
 
 		 179 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  38.37 
 
 		 776 aa  92.4  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.44 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2937  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 195 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 		 175 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.26 
 
 		 734 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  43.36 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  39.89 
 
 		 727 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  38.76 
 
 		 903 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  40.78 
 
 		 389 aa  90.5  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  45.26 
 
 		 174 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  41.25 
 
 		 448 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 203 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  36.27 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  41.29 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.95 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.74 
 
 		 525 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  46.67 
 
 		 165 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  36.57 
 
 		 401 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.83 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  50.83 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 225 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  40.65 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  41.96 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  41.96 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  31.86 
 
 		 440 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>