More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0299 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0299  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 79 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0344  GntR family transcriptional regulator  88.61 
 
 		 79 aa  146  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.392311  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0345  regulatory protein GntR HTH  67.09 
 
 		 78 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631612  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  42.65 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 259 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6358  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107299  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5299  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 234 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 257 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 482 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.3 
 
 		 243 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 243 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  39.13 
 
 		 351 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  36.11 
 
 		 120 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  40.3 
 
 		 243 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  40.3 
 
 		 243 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  40.3 
 
 		 265 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  40.3 
 
 		 243 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  40.3 
 
 		 243 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  40.3 
 
 		 243 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 241 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  37.5 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  37.5 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 241 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 245 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 321 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 287 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  34.29 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 244 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1929  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0126  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000292092  hitchhiker  0.0000000000517397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.54 
 
 		 472 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 239 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  40 
 
 		 243 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 239 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0259  regulatory protein GntR, HTH  40.54 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0954  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 258 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  36.23 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.8 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  40.58 
 
 		 244 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.8 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 256 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  34.29 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  34.29 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  46.97 
 
 		 239 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 261 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 261 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2750  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  36.23 
 
 		 379 aa  48.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0161564  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  34.29 
 
 		 231 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.76 
 
 		 467 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  36.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  34.29 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  33.8 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  34.29 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  36.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 284 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  34.29 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  33.8 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3803  regulatory protein GntR, HTH  37.88 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704328  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  36.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  36.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  36.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  33.8 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  36.23 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  33.8 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  34.29 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  35.82 
 
 		 274 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 249 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  35.62 
 
 		 264 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>