38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0235 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  88.89 
 
 		 122 aa  212  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  48.08 
 
 		 277 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  51.65 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  49.04 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  42.86 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  49.51 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  49.51 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.23 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.08 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  45.19 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.23 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  47.17 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  42.31 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  43.27 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  41.35 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  41.35 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  41.35 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.75 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  39.78 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  41.03 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  41.76 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  35.16 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  39.08 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  35.48 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  33.65 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  34.78 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 110 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 110 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 		 109 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  31.88 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  30.43 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  33.73 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>