151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0198 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  92.98 
 
 
356 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  59.37 
 
 
337 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0448  PHP domain protein  58.91 
 
 
357 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  54.55 
 
 
339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  53.43 
 
 
334 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  52.86 
 
 
334 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  52.86 
 
 
334 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4865  hypothetical protein  55.04 
 
 
332 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113999  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1522  hypothetical protein  58.57 
 
 
378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  51.97 
 
 
344 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  54.44 
 
 
339 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  51.14 
 
 
334 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  51.71 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  50.86 
 
 
335 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  54.29 
 
 
381 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  49.71 
 
 
349 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  53.41 
 
 
347 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06190  hypothetical protein  48.01 
 
 
360 aa  282  7.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  38.4 
 
 
573 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  40.94 
 
 
588 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  38 
 
 
572 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  38 
 
 
572 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  38 
 
 
572 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  38 
 
 
573 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  38 
 
 
572 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  38 
 
 
573 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  42.46 
 
 
560 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  38 
 
 
572 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  38.4 
 
 
573 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  38.8 
 
 
572 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  37.6 
 
 
572 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  37.6 
 
 
572 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  41.67 
 
 
578 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  41.77 
 
 
584 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  41.3 
 
 
578 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  44.66 
 
 
650 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  39.68 
 
 
573 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  38.06 
 
 
574 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  39.92 
 
 
584 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  39.68 
 
 
584 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  43.62 
 
 
574 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  41.18 
 
 
580 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  38.43 
 
 
563 aa  173  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  35.12 
 
 
571 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  39.53 
 
 
580 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  37.9 
 
 
570 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  38.8 
 
 
577 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  40.16 
 
 
569 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  37.45 
 
 
557 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  41.56 
 
 
614 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  38.15 
 
 
576 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  40.89 
 
 
572 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  39.61 
 
 
578 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  31.99 
 
 
569 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  36.95 
 
 
569 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  35.25 
 
 
580 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  39.27 
 
 
598 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  40.64 
 
 
560 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  34.57 
 
 
582 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  39.84 
 
 
532 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  40.96 
 
 
536 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 
562 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  37.6 
 
 
579 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  36.69 
 
 
594 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  36.69 
 
 
578 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  38.68 
 
 
574 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  32.44 
 
 
570 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  32.44 
 
 
570 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  39 
 
 
577 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  37.2 
 
 
543 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  39.27 
 
 
576 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  39.27 
 
 
576 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  35.22 
 
 
570 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  39.84 
 
 
574 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  38.11 
 
 
582 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  38.11 
 
 
582 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  39.45 
 
 
572 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  37.5 
 
 
580 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  36 
 
 
557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  39.11 
 
 
576 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  37.15 
 
 
583 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  38.59 
 
 
592 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  39.09 
 
 
642 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  36.76 
 
 
562 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  39.09 
 
 
650 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  36.43 
 
 
558 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  36.51 
 
 
574 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  35 
 
 
566 aa  150  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  39.17 
 
 
580 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.83 
 
 
740 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 
586 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  39.68 
 
 
589 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  32.4 
 
 
576 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  37.55 
 
 
592 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  35.74 
 
 
586 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  37.55 
 
 
592 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  37.14 
 
 
592 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  36.25 
 
 
578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  35.92 
 
 
577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>