More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0193 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  82.99 
 
 		 393 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 398 aa  797    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  44.83 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  47.98 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  45.62 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  43.65 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  43.83 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  43.65 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  45.36 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  45.43 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  42.22 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 455 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 		 392 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 		 518 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  34.04 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  36.71 
 
 		 440 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  35.37 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 565 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 605 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.38 
 
 		 364 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 361 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  27.89 
 
 		 361 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 401 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 414 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  36.21 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 446 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 416 aa  89.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 417 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  36.48 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.63 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 414 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 		 370 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  37.88 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 822 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.55 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.55 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.64 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  27.32 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  30.36 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.45 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 		 770 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  34.5 
 
 		 935 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.19 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.72 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>