More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0145 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  97.89 
 
 		 237 aa  453  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  61.74 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2890  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 261 aa  99  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  32.94 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.54 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.54 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  41.73 
 
 		 175 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.45 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  27.2 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.05 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 126 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  40.43 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  24.15 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  43.94 
 
 		 83 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 129 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>