More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0119 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 401 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  95.76 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  61.01 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  59.55 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  60.67 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  60.21 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  59.34 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.1 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  60.91 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  60.05 
 
 		 395 aa  351  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  59.7 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  61.31 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  54.2 
 
 		 388 aa  304  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  59.13 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  55.98 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  53.48 
 
 		 385 aa  297  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  56.66 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  51.6 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  51.34 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  51.34 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  51.87 
 
 		 373 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  48.74 
 
 		 388 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  39.84 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  37.87 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  37.79 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  39.75 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  37.72 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.7 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.93 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 		 407 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.18 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.18 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.68 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  31.68 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.8 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.8 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  33.16 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  33.16 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.37 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.37 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  34.26 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 		 587 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 586 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 586 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 747 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 586 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 586 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.66 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.06 
 
 		 585 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 586 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  30.05 
 
 		 563 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 585 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 745 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  29.3 
 
 		 585 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.51 
 
 		 587 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.57 
 
 		 585 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 710 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 		 669 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 		 669 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 		 669 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  30.39 
 
 		 669 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  29.46 
 
 		 663 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 		 669 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 657 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 		 669 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 567 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  30.39 
 
 		 663 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.55 
 
 		 588 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 757 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03045  cation-efflux system transmembrane protein  30.9 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  31.03 
 
 		 567 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  30.62 
 
 		 568 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 764 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 782 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 		 674 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 741 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  28.76 
 
 		 562 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  28.75 
 
 		 562 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.68 
 
 		 741 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  29.67 
 
 		 583 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2272  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 578 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.668389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  28.43 
 
 		 563 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  29.81 
 
 		 575 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 656 aa  106  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  31.5 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>