More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0114 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  100 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  77.59 
 
 		 299 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  57.65 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  60.56 
 
 		 218 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  61.59 
 
 		 193 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  63.08 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  55.21 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  43.88 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  56.72 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  51.77 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  54.55 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  52.27 
 
 		 193 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  54.62 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  57.48 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  57.48 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  57.48 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  57.48 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  48.95 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  46.39 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  51.06 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  39.91 
 
 		 222 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  48.05 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  44.2 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  52.76 
 
 		 235 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  50 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  56.55 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  45.76 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  50.88 
 
 		 199 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  48.08 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.89 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.75 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  49.59 
 
 		 208 aa  115  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.45 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  44.44 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  36.61 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35.23 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  42.45 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.4 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  43.37 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.12 
 
 		 223 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.67 
 
 		 190 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.33 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  38 
 
 		 181 aa  95.9  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  39.39 
 
 		 189 aa  95.5  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.39 
 
 		 198 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  37.91 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  29.88 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 195 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  32.48 
 
 		 286 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  33.71 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  35.71 
 
 		 181 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  35.76 
 
 		 201 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.95 
 
 		 197 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.69 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.69 
 
 		 225 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.58 
 
 		 186 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  30.68 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  29.19 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  29.19 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  39.84 
 
 		 207 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.85 
 
 		 194 aa  88.6  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  38.89 
 
 		 201 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  29.79 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  33.08 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  41.45 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  33.56 
 
 		 172 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  31.49 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  33.56 
 
 		 172 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  39.73 
 
 		 189 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 		 199 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  28.98 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  29.78 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  31.76 
 
 		 259 aa  85.5  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.88 
 
 		 181 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  30.77 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.14 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  27.44 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.86 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  30.68 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  35.48 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  31.62 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  39.33 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  26.4 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 		 195 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 		 195 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  32.82 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  38 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.73 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>