More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0108 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  100 
 
 		 329 aa  668    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  97.26 
 
 		 329 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  73.72 
 
 		 388 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  71.86 
 
 		 353 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  73.01 
 
 		 324 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  73.23 
 
 		 327 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  70.82 
 
 		 327 aa  484  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  74.76 
 
 		 327 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  70.73 
 
 		 340 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  72.78 
 
 		 331 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  72.04 
 
 		 326 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  70.34 
 
 		 328 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  72.56 
 
 		 326 aa  471  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  67.69 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  70.31 
 
 		 335 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  68.81 
 
 		 329 aa  467  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  69.91 
 
 		 345 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  64.53 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  64.99 
 
 		 335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  64.24 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  65.86 
 
 		 357 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  65.74 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  58.9 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  65.12 
 
 		 345 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  63.78 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  65.94 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  63.47 
 
 		 706 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  60.62 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  66.88 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  64.4 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  60 
 
 		 326 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  62.58 
 
 		 355 aa  408  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  62.54 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  59.01 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  57.94 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  57.58 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  57.81 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  58.54 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  57.66 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  57.67 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  57.55 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  55.42 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  56.97 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  56.97 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  56.97 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  57.5 
 
 		 329 aa  359  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  51.82 
 
 		 354 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  53.37 
 
 		 348 aa  350  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  56.39 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  55.45 
 
 		 334 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  54.03 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  53.21 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  53.89 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  53.89 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  52.81 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  51.23 
 
 		 342 aa  319  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  50.61 
 
 		 336 aa  319  5e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  49.85 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  50.46 
 
 		 335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  50.76 
 
 		 332 aa  312  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  47.87 
 
 		 326 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.26 
 
 		 351 aa  311  9e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  50.15 
 
 		 326 aa  309  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  49.39 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  48.9 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  47.37 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  48.62 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.09 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  49.69 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  48.15 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.62 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  46.69 
 
 		 325 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  46.49 
 
 		 339 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  47.51 
 
 		 346 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  51.4 
 
 		 326 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  47.51 
 
 		 346 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  47.51 
 
 		 346 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  47.37 
 
 		 326 aa  301  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  50.31 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  48.3 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  48.16 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  47.21 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.21 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  47.3 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.35 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.21 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.21 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  47.21 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2301  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.21 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1410  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.48 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.21 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  48.79 
 
 		 337 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.18 
 
 		 337 aa  298  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.18 
 
 		 337 aa  298  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2303  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.92 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  46.83 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  46.63 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  46.63 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  46.9 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>