225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0099 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 255 aa  507  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  88.35 
 
 		 249 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  58.47 
 
 		 254 aa  279  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  57.43 
 
 		 251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  56.35 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  58.17 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  59.68 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  60.48 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  57.03 
 
 		 301 aa  264  8.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  57.26 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  52.82 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  53.23 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  53.41 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  53.41 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  53.41 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  52.94 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  51.6 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 254 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  53.31 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  54.03 
 
 		 304 aa  235  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 264 aa  235  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  52 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  55.2 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 254 aa  232  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.21 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  53.23 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.21 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 		 260 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  41.18 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  52.65 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  44.22 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.62 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  47.33 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  42.39 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  39.18 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  41.63 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  45.27 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  44.84 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  44.08 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  41.63 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  44.86 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  44.35 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  45.16 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  44.58 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  44.08 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  38.31 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  43.51 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  43.51 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  39.18 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  43.51 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>