More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0085 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  100 
 
 
296 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  92.57 
 
 
296 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  55.78 
 
 
310 aa  328  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.12 
 
 
296 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  54.79 
 
 
293 aa  298  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  52.94 
 
 
302 aa  298  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  51.39 
 
 
295 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  52.81 
 
 
301 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  48.77 
 
 
283 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  44.04 
 
 
303 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  42.18 
 
 
297 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  39.12 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  44 
 
 
284 aa  158  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 
287 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  33.77 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  32.44 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  32.44 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  32.44 
 
 
285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  33.47 
 
 
286 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  32.68 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  33.33 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  32.29 
 
 
310 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 
306 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  39.2 
 
 
294 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  32.59 
 
 
307 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  30.65 
 
 
310 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  30.22 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  35.03 
 
 
413 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  32.58 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  33.48 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.48 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  26.94 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 
316 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  31.16 
 
 
334 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  34.56 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.5 
 
 
306 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  25.55 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  31.97 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  28.17 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  31.82 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  34.72 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  33.16 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  34.97 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  33.83 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  31.89 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  34.91 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  33.49 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  28.22 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  24.36 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  24.36 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  24.36 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  30.81 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  29.24 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  28.78 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  30.26 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  30.6 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.05 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.9 
 
 
507 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  31.22 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.31 
 
 
328 aa  79  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  33.09 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  31.2 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  33.33 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.67 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  30.51 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  31.3 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  30.51 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  30.51 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  30.87 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 
753 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  30.34 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  28.02 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  31.34 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  30.13 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  26.05 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  27.43 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  30.58 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  28.71 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  29.25 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  25.18 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  31.09 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  31.31 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
557 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  31.6 
 
 
764 aa  75.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 
543 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.73 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  31.63 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  33.71 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>