74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0083 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  92.39 
 
 
289 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  67.48 
 
 
288 aa  338  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  61.75 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  27.24 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 
295 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
299 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  29.85 
 
 
308 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
285 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  31.47 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  28.91 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
586 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
588 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  26.78 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 
137 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  31.15 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  32.32 
 
 
546 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  27.98 
 
 
277 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  28.35 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  31.58 
 
 
333 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  30.17 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  31.86 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  29.46 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  31.25 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
545 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  29.51 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  29.45 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  24.34 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  32.14 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
268 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  31.79 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  31.2 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  30.77 
 
 
323 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  28.23 
 
 
316 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  30.25 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 
285 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
322 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
275 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>