More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0081 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  100 
 
 		 513 aa  1048    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  49.76 
 
 		 466 aa  412  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  48.98 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  48.97 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  49.66 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  48.97 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  47.84 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  48.97 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  47.72 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  48.53 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  49.2 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  49.43 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  47.38 
 
 		 437 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  48.28 
 
 		 433 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  46.96 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  46.96 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  46.96 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  46.72 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  46.72 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  45.02 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  46.72 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  46.72 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  44.55 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  48.05 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  46.47 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  45.45 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  47.38 
 
 		 456 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  44.34 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  44.12 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  47.62 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  46.55 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  45.21 
 
 		 429 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  45.33 
 
 		 432 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  43.54 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  43.35 
 
 		 431 aa  360  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  45.02 
 
 		 446 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  45.37 
 
 		 453 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  46.3 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  44.58 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  44.83 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  43.84 
 
 		 440 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  44.83 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  44.83 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  44.83 
 
 		 438 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  44.34 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  44.09 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  45.78 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  45.18 
 
 		 434 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  44.06 
 
 		 425 aa  336  5.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  43.17 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  43.96 
 
 		 452 aa  332  9e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  43.03 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  43.72 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  44.78 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  43.48 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  44.83 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  42.2 
 
 		 445 aa  329  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  43.81 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  43.73 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  43.27 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  44.2 
 
 		 435 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  42.01 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  46.51 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  41.69 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  43.73 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  43.75 
 
 		 437 aa  323  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  43.12 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  45.95 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  42.59 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  43.21 
 
 		 428 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  42.72 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  44.21 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  45.99 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  42.65 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  45.99 
 
 		 436 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  45.99 
 
 		 436 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  45.99 
 
 		 436 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  45.99 
 
 		 436 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  45.99 
 
 		 436 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  45.99 
 
 		 436 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  43.13 
 
 		 445 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  40.59 
 
 		 428 aa  301  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  41.56 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  41.18 
 
 		 428 aa  300  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  39.52 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  36.86 
 
 		 465 aa  289  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  40.39 
 
 		 427 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  40.15 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  38.63 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  38.59 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  39.86 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  39.32 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  37.69 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  36.96 
 
 		 430 aa  261  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  39.66 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  38.76 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  35.47 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  36.26 
 
 		 447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2966  amidohydrolase  35.81 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  35.77 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>