More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0073 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0073  HAD family hydrolase  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  77.19 
 
 		 231 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0328  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  46.82 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0916  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.97 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.91 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  34.19 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  31.67 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.65 
 
 		 190 aa  62  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.02 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.3 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  33.96 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  35.04 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  33.9 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.71 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  29 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  32 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.09 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.67 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.71 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  26.37 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  24.7 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04348  phosphoglycolate phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00760)  25.63 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161139  normal  0.520763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  31.45 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  26.56 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0190  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.34 
 
 		 178 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  28.15 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  30.9 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  33.72 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  35.61 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.73 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.45 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  30.94 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  28.36 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  31.2 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  25.51 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  34.21 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.15 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  29.75 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  31.93 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  45.76 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  26.46 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  25.78 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  26.67 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  31.93 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  35.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  35.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  24.14 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  35.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.47 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  35.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  24.14 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  29.46 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>