275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0058 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  100 
 
 		 395 aa  803    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  66.1 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  51.4 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0074  hypothetical protein  90.52 
 
 		 117 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532123  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  37.37 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  33.85 
 
 		 388 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  34.13 
 
 		 385 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  34.97 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  35.42 
 
 		 379 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  35.14 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  32.45 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  32.63 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  30.68 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.2 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  31.71 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  30.03 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.21 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  32.01 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.88 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  27.83 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  29.47 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  28.49 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  27.79 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.09 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.16 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.73 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  27.06 
 
 		 399 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  27.81 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  31.01 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.16 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.34 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  29.4 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.16 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.47 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.6 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.16 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.79 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.46 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.65 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.81 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  28.01 
 
 		 451 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.81 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.76 
 
 		 370 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.06 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.82 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.23 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.36 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  28.05 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  26.95 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.85 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  27.95 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.13 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.77 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.9 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.71 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  26.89 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.64 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  30.31 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  29.77 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.92 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.05 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  26.92 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  30.04 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.69 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  28.13 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.38 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.44 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.88 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  32.82 
 
 		 198 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  26.58 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.87 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  22.82 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.75 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.46 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.46 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.1 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.63 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.89 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  28.14 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.35 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  28.99 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.22 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.22 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.02 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>